Hinter Unterammergau durchfließt der Fluss das Ammer-Loisach-Hügelland und schneidet sich bis 80 m tief in den Grund ein. Die Ammerschlucht hat mehrere Naturschutzgebiete.
Sehenswert ist die Echelsbacher Brücke. Diese war zu ihrer Zeit 1929 die höchste und freitragende Beton-Bogenbrücke der Welt. Sie entschärfte den schwierigen Flussübergang der alten Römerstraße Via Raetia, heute die B 27.
Südlich des Hohen Peißenberg wendet der Fluss sich nach Osten und umfließt das Bergmassiv. Danach nimmt die Ammer ihren Lauf nach Norden auf und durchfließt Weilheim und den Ammersee.
Vom Ammersee passiert der Fluss, nun Amper genannt, die Städte Eching am Ammersee, Fürstenfeldbruck und Dachau, um bei Moosburg in die Isar zu münden.
Entlang des Flusses gibt es mehrere Radwanderwege.
Die Linder ist ein kleiner Gebirgsfluss südlich von Oberammergau. Er ist einer der Quellflüsse der Ammer. Die Quelle befindet sich südwestlich vom Schlosses Linderhof im Grenzgebiet zwischen Deutschland und Österreich.
Die Linder fließt in nordöstlicher Richtung durch das Graswangtal. Auf ihrem Lauf versickert viel Flusswasser im Karstuntergrund. Teils liegt der Fluss trocken. Das Linderwasser tritt dann im Weidmoos in mehreren Quelltöpfen der Großen und Kleinen Ammer wieder zutage.
Bei Graswang wurde der Flusslauf befestigt und teils verlagert. Ab den Quelltöpfen im Weidmoos trägt der Fluss den Namen Ammer.
Ammer-Amper-Radweg
Länge de Hautstrecke: 201 km
Von Oberammergau nach Dießen am Ammersee: Fahrstrecke 76,7 km
- Ausflug Kloster Ettal, Schloss Lindenhof und Ammerquellen
- Zur Wieskirch
- Rundtour Kloster Andechs (25km)
Von Dießen am Ammersee nach Dachau | Fahrstrecke: 57,1km
Von Dießen nach Moosburg an der Isar | Fahrstrecke: 66,8km
- Variante nach Freising
Der Ammer-Amper-Radweg wurde 2019 erstmalig als Qualitätsradtroute zertifiziert. 2022 erfolgte die Auszeichnung mit 4 Sternen.
